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微生物病原体鉴定

概要:
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  产品介绍

  基于一代、二代、三代测序服务结合qPCR等相关技术对已知或未知分离培养物样本中病原体进行鉴定,获取全基因组序列 ,以及对序列进行基因注释,ORF划分,GC占比分析,测序深度分析,SNV,蛋白构象结构等分析,以及个性化定制的溯源进化树分析等服务内容。

 

  研究内容

  用于病原序列鉴定。

 

  产品优势

  策略多样:除常规的高通量测序文库外,还可根据病毒序列复杂性调整测序模式,满足客户研究需求。

  通量大:宏微特斯拥有十万级标准PCR实验室和测序实验室;ABI 3730XL测序仪illumina测序仪,华大基因MGI-2000测序仪,ABI7500荧光定量仪器,测序成本低,周期短。

  样品种类多:疫苗株,野生毒,鸡(鸭)胚尿囊液,培养细胞系,临床样本等。

  信息分析内容全面:实时跟进科学研究前沿,不断升级信息分析内容。

  个性化分析:具有丰富个性化分析经验,可根据项目需要选择最适宜的分析软件,只为保障最精准结果。

  更多新发现:可以发现新的SNV,研究其蛋白构象及余元分析。

  经验丰富:技术团队来自于中国科学院北京基因研究所、中国科学院北京微生物研究所,军事医学科学院等知名科研院所,拥有良好的技术基础,在基因组测序领域(包括疫苗测序)发表数十篇文章。

 

  报告模板

 

 

  合作单位

  军事科学院军事医学研究院,国家疾控CDC,黑龙江科技厅,江西省CDC,协和医院,北京市胸科医院,

 

  已发文章

基因组测序相关文献

  1. Wei Feng, Dongsheng Zhou, et al. Dissemination of IMP-4-encoding pIMP-HZ1-related plasmids among klebsiella pneumonia and Pseudomonas aeruginosa in a Chinese teaching hospital. Scientific Reports 2016(6): 33419.

  2. Li Wang, Lei Liu, et al. The first report of a fully sequenced resistance plasmid form Shigella boydii. Frontiers in Microbiology 2016(7): 1579.

  3. Xiankai Liu, Xinpeng Qi, et al. Genome sequence of Bacillus anthracis attenuated vaccine strain A16R used for human in China. Journal of Biotechnology 210 (2015) 15–16.

  4. Yuanyua Zhang, Chen Chen, et al. Complete Genome Sequences of Mycobacterium tuberculosis Strains CCDC5079 and CCDC5080, Which Belong to the Beijing Family. Journal of Bacteriology 2011; 193: 5591-5592.

  5. Zhao x, Wu weili, et al. The complete genome sequence and proteomics of Yersinia pestis phage Yep-phi. J Gen Virol (2011); 92: 216-221.

  6. 王静宇,吴伟立等。麻疹病毒CC47疫苗测序分析及与其他A基因型病毒株比较。黑龙江大学自然科学学报 (2010);3:275-385。

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